국화재배에서 어려움을 겪는 것 중의 하나가 병충해 방제법이다. 특히 작품성을 높이는데는 더욱 그렇다. 이것은 병충해가 발생 하였을때는 이미 피해를 보고 있기 때문에 그만큼 작품의 가치를 상실했기 때문이다. 정성들여 가꾼 국화가 잠깐 동안의 무관심과 부주의로 피해를 보고 이것을 아쉽고 서운해하는 재배가들을 가끔 볼 수 있기 때문이다.

병충해의 피해는 그 정도에 따라 잎이나 꽃을 갉아 먹었다던가, 예쁘게 자라고 있는 새싹의 눈을 침식했다던가, 연한줄기를 씹어 부러뜨렸다던가, 잎에 얼룩이 생겨서 보기 흉하다던가등등 여러 가지 피해를 입게 된다.
이와같은 피해를 입게되면 회복이 불가능하기 때문에 피해를 입은만큼 작품성의 가치가 떨어지게 되는 것이다.
국화는 병충해의 종류가 많기 때문에 국화재배의 전기간중에 어디나 가리지 않고 언제나 피해를 입게된다. 따라서 국화재배에 임할때는 이와같은 피해를 주는 병이나 벌레가 국화에 접근하지 못하게 미리 예방하는 것이 중요하며 바람직하다.

병충해의 예방법으로서는 관찰을 게을리하지 말고 모분관리나 모종때부터 병이나 벌레가 침범하지 못하도록 사전에 정기적으로 해당농약을 살포할것이며 발생했을 경우에는 즉시 농약을 살포하여 구제해야 한다. 시중 농약상이나 종묘상에는 사용법의 설명서가 첨부된 각종 병충해의 새로운 특효 농약을 판매하고 있기 때문에 사용법을 잘 지킨다면 병충해는 그리 큰 문제가 되지 않으리라고 본다.

예방을 위한 농약살포는 2주 간격으로 정기적으로 실시한다. 또 농약을 사용할때는 같은 종류의 농약을 계속 쓰지말고 다른종류의 농약과 번갈아가며 쓰는 것이 좋다. 같은 농약만 계속 쓰면 면역이 생겨 효과가 떨어지기 때문이다. 농약을 살포할때는 살균제나 살충제를 같이 혼합해서 동시에 살포하는 것이 편하지만 혼합가부 여하를 잘 알고 써야 약해를 입지 않게 된다.